めぐみ会本部は、法人全体の運営管理のサポートを行い、医療サービスの質の向上をめざした組織強化や事業推進の支援をおこなっています。企画開発部・医師人事部・職員人事部・経理部・総務部・資材管理室・健診営業部・渉外部・広報室・システム部・等があります。
